MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY06

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009472	CAG	2	6	71	76	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244118
2	NC_009472	GTA	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244118
3	NC_009472	TGG	2	6	216	221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244118
4	NC_009472	GC	3	6	224	229	0 %	0 %	50 %	50 %	148244118
5	NC_009472	TCA	2	6	256	261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244118
6	NC_009472	GCG	2	6	274	279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244118
7	NC_009472	CGC	2	6	1245	1250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
8	NC_009472	CACG	2	8	1327	1334	25 %	0 %	25 %	50 %	148244119
9	NC_009472	TCG	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
10	NC_009472	CAGC	2	8	1361	1368	25 %	0 %	25 %	50 %	148244119
11	NC_009472	GCC	2	6	1486	1491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
12	NC_009472	GC	3	6	1515	1520	0 %	0 %	50 %	50 %	148244119
13	NC_009472	CGG	2	6	1526	1531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
14	NC_009472	GCCCG	2	10	1577	1586	0 %	0 %	40 %	60 %	148244119
15	NC_009472	CCG	2	6	1617	1622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
16	NC_009472	CGC	2	6	1674	1679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
17	NC_009472	CGT	2	6	1687	1692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
18	NC_009472	GCT	2	6	1716	1721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
19	NC_009472	CTG	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
20	NC_009472	CGC	2	6	1782	1787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
21	NC_009472	CGC	2	6	1825	1830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
22	NC_009472	CTT	2	6	1833	1838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244119
23	NC_009472	TCG	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
24	NC_009472	GGC	2	6	1854	1859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
25	NC_009472	TCG	2	6	1897	1902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
26	NC_009472	TCG	2	6	1942	1947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
27	NC_009472	CGGCG	2	10	1965	1974	0 %	0 %	60 %	40 %	148244119
28	NC_009472	CG	3	6	1979	1984	0 %	0 %	50 %	50 %	148244119
29	NC_009472	CGA	2	6	2027	2032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
30	NC_009472	CG	3	6	2037	2042	0 %	0 %	50 %	50 %	148244119
31	NC_009472	TCT	2	6	2164	2169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244119
32	NC_009472	TGC	2	6	2207	2212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
33	NC_009472	CG	4	8	2267	2274	0 %	0 %	50 %	50 %	148244119
34	NC_009472	CGA	2	6	2279	2284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
35	NC_009472	CTT	2	6	2333	2338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244119
36	NC_009472	GCC	2	6	2386	2391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
37	NC_009472	ACG	2	6	2392	2397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
38	NC_009472	CTG	2	6	2408	2413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
39	NC_009472	CGCC	2	8	2431	2438	0 %	0 %	25 %	75 %	148244119
40	NC_009472	CGA	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
41	NC_009472	CGG	2	6	2555	2560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
42	NC_009472	CG	3	6	2561	2566	0 %	0 %	50 %	50 %	148244119
43	NC_009472	C	6	6	2573	2578	0 %	0 %	0 %	100 %	148244119
44	NC_009472	GAC	2	6	2628	2633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
45	NC_009472	CGA	2	6	2693	2698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
46	NC_009472	TCG	2	6	2707	2712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
47	NC_009472	CAG	2	6	2718	2723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
48	NC_009472	GCC	2	6	2867	2872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
49	NC_009472	GAG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244119
50	NC_009472	GCGCTG	2	12	3018	3029	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	148244119
51	NC_009472	GCGA	2	8	3033	3040	25 %	0 %	50 %	25 %	148244119
52	NC_009472	CGG	2	6	3082	3087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
53	NC_009472	GCC	2	6	3102	3107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
54	NC_009472	GC	4	8	3125	3132	0 %	0 %	50 %	50 %	148244119
55	NC_009472	CGG	2	6	3209	3214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
56	NC_009472	A	6	6	3305	3310	100 %	0 %	0 %	0 %	148244119
57	NC_009472	GGGAGG	2	12	3371	3382	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	148244119
58	NC_009472	CGC	2	6	3395	3400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
59	NC_009472	CGC	2	6	3403	3408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
60	NC_009472	GC	3	6	3407	3412	0 %	0 %	50 %	50 %	148244119
61	NC_009472	GCCA	2	8	3417	3424	25 %	0 %	25 %	50 %	148244119
62	NC_009472	GCCGC	2	10	3439	3448	0 %	0 %	40 %	60 %	148244119
63	NC_009472	CGG	2	6	3539	3544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
64	NC_009472	TGA	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244119
65	NC_009472	GTC	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
66	NC_009472	CGG	2	6	3662	3667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
67	NC_009472	CAG	2	6	3744	3749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
68	NC_009472	CGG	2	6	4046	4051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
69	NC_009472	AGG	2	6	4081	4086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244119
70	NC_009472	CGC	2	6	4269	4274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
71	NC_009472	CCGG	2	8	4290	4297	0 %	0 %	50 %	50 %	148244119
72	NC_009472	TGC	2	6	4375	4380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244119
73	NC_009472	CGC	2	6	4398	4403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244119
74	NC_009472	GAC	2	6	4408	4413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244119
75	NC_009472	CGG	2	6	4414	4419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244119
76	NC_009472	CAG	2	6	4777	4782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244120
77	NC_009472	TGC	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244120
78	NC_009472	CGG	3	9	4808	4816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244120
79	NC_009472	CAAG	2	8	4840	4847	50 %	0 %	25 %	25 %	148244120
80	NC_009472	TGA	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244120
81	NC_009472	CGA	2	6	4912	4917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244120
82	NC_009472	GCG	2	6	4937	4942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244120
83	NC_009472	GCC	2	6	5015	5020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244120
84	NC_009472	GGC	2	6	5097	5102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244120
85	NC_009472	GC	4	8	5126	5133	0 %	0 %	50 %	50 %	148244120
86	NC_009472	AGG	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244120
87	NC_009472	GCC	2	6	5156	5161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244120
88	NC_009472	GGGC	2	8	5183	5190	0 %	0 %	75 %	25 %	148244120
89	NC_009472	GC	3	6	5206	5211	0 %	0 %	50 %	50 %	148244120
90	NC_009472	GCT	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244120
91	NC_009472	GCTG	2	8	5277	5284	0 %	25 %	50 %	25 %	148244120
92	NC_009472	TGC	2	6	5295	5300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244120
93	NC_009472	CGT	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244121
94	NC_009472	GCATC	2	10	6715	6724	20 %	20 %	20 %	40 %	148244121
95	NC_009472	GATC	2	8	6733	6740	25 %	25 %	25 %	25 %	148244121
96	NC_009472	GAC	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244121
97	NC_009472	CG	3	6	6780	6785	0 %	0 %	50 %	50 %	148244121
98	NC_009472	ATC	2	6	6837	6842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244121
99	NC_009472	GCC	2	6	6843	6848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244121
100	NC_009472	CCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244121
101	NC_009472	G	6	6	7273	7278	0 %	0 %	100 %	0 %	148244122
102	NC_009472	GCA	2	6	7291	7296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244122
103	NC_009472	CTT	2	6	7371	7376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244122
104	NC_009472	CCAT	2	8	7437	7444	25 %	25 %	0 %	50 %	148244122
105	NC_009472	CGA	2	6	7450	7455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244122
106	NC_009472	AAG	2	6	7519	7524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244122
107	NC_009472	CTG	2	6	7548	7553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244123
108	NC_009472	GTG	2	6	7592	7597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244123
109	NC_009472	GCG	2	6	7676	7681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244123
110	NC_009472	GTTC	2	8	7682	7689	0 %	50 %	25 %	25 %	148244123
111	NC_009472	TCC	2	6	7753	7758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244124
112	NC_009472	TCA	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244124
113	NC_009472	GCA	3	9	8015	8023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244124
114	NC_009472	CGC	2	6	8057	8062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244124
115	NC_009472	GAT	2	6	8085	8090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244124
116	NC_009472	CGG	2	6	8102	8107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244124
117	NC_009472	GCGTT	2	10	8177	8186	0 %	40 %	40 %	20 %	148244124
118	NC_009472	CTCG	2	8	8537	8544	0 %	25 %	25 %	50 %	148244126
119	NC_009472	CGA	2	6	8573	8578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244126
120	NC_009472	TGCG	2	8	8601	8608	0 %	25 %	50 %	25 %	148244126

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.